Author: Torbjørn Ekrem

  • Ny art får navn etter strekkodingens far

    I en artikkel nylig publisert i tidsskriftet Insect Systematics and Evolution beskriver Xiaolong Lin, som nylig forsvarte sin PhD-avhandling ved NTNU, hele åtte nye arter for vitenskapen hvorav to er funnet i Norge.

    – Det er spesielt gøy å oppdage nye arter fra relativt godt undersøkte områder slik som Norge, sier Lin. – Men, også spennende å finne beslektede nye arter i mitt hjemland Kina.

    For å se forskjell på fjærmyggartene må en ta et mikroskop i bruk, men også DNA-strekkoding kan brukes til å skille arter. Paul Hebert, som nylig fikk stående applaus på Starmus-festivalen i Trondheim, er en stor og anerkjent kapasitet innen biomangfoldforskningen og regnes som strekkodingens far.

    – Ettersom flere av de nye artene først ble oppdaget gjennom DNA-strekkoding, var det naturlig å gi en av dem navn etter Paul Hebert, forteller Lin. – At denne arten i tillegg var funnet i arktisk Canada, et område Hebert har jobbet mye, var et ekstra pluss.

    Tanytarsus heberti, den lille myggen på 2,5 mm fra Churchill og Wapusk nasjonalpark i Manitoba, skiller seg fra sine nærmeste slektninger på sin lyse farge, små detaljer i hannens genitalier og en karakteristisk DNA-strekkode.

    Medforfattere og veiledere Elisabeth Stur og Torbjørn Ekrem ved NTNU Vitenskapsmuseet utdyper:

    – Xiaolong har gjort en svært grundig og god undersøkelse av denne gruppen fjærmygg. Ikke bare beskriver han nye arter i sin avhandling, men analyserer også deres evolusjonære slektskap og geografiske utbredelse. Det er et stort bidrag til vår kunnskap om en artsrik og viktig insektgruppe i vår natur.

    Xiaolong LinDr. Xiaolong Lin etter forsvar av PhD-avhandlingen sin ved NTNU. Foto: Torbjørn Ekrem CC-BY.

    Lin, X., Stur, E. og Ekrem, T. 2017. DNA barcodes and morphology support new species in Chironomidae (Diptera). Insect Systematics and Evolution XX:00-00.

  • Høstsopptreff i Bodø

    Helgen 7-10 september var det fagdag om marine sopper og høstsopptreff i Bodø arrangert av Salten naturlag. Det ble arrangert turer fredag, lørdag og søndag, der totalt 24 forskjellige lokaliteter ble besøkt. NorBOL hadde mulighet til å delta på tur og smale inn sopp i strålende flott vær på fredagen.

    PanoramaIkke noe å si på været. Foto Marie K. Føreid Merkel CC-BY.

    Det ble samlet inn store mengder sopp og det ble gjort flere interessante funn. NorBOL hadde som slagplan for treffet å få tatt prøve av alle artene som vi ikke har prøve av fra Nordland fra før av. Og vi fikk dermed tak i ca 200 prøver av tilsvarende antall arter. Vi fikk også samlet inn en del larver av soppmygg i løpet av treffet så det ble en fin fangst. Vi er dermed strålende fornøyde med helgen så takk til Salten Naturlag for et flott høstsopptreff, flotte turer, fint sosialt samvær og mange sopp til strekkoding.

    Marie K. Føreid Merkel & Gunnhild Marthinsen

    Sopp i kurvenSopp i kurven. Foto Marie K. Føreid Merkel CC-BY.

    Gunnhild og Marie I feltGunnhild og Marie i felt. Foto Gunnhild Marthinsen CC-BY.

  • Soppens dag på Tromsø museum

    Søndag 3. september var det soppens dag ved Tromsø museum, med sopputstilling, soppkontroll og sopptur. Det var Tromsø soppforening som sto for arrangementet og de hadde plukket inn mange flotte arter til en mangfoldig utstilling av spiselige sopper, ikke-matsopper og giftige sopper.

    Arrangementet varte i rundt fire timer og det var mange innom for å få fangsten sin kontrollert, lære mer om sopp, samt plukke opp generelle tips. Mange fikk også med seg litt informasjon om DNA-strekkoding av sopp og soppmygg fra oss i NorBOL.

    Det var dekket til langbord ved Tromsø museum 3. september. Foto: Marie Føreid Merkel CC-BY.Det var dekket til langbord ved Tromsø museum 3. september. Foto: Marie Føreid Merkel CC-BY.

    Det har tidligere blitt strekkodet en god del av de vanligste artene av sopp fra Nord-Norge, men på soppens dag ble det  funnet 10 nye som vi ikke har strekkodet fra de tre nordligste fylkene fra før. Stor takk til Tromsø soppforening for at NorBOL fikk være med; vi er storfornøyd med de flotte eksemplarene fra utstillingen og sopper som publikum hadde funnet.

    Neste helg (7-10. september) er det høstsopptreff og fagdag i Bodø i regi av Salten naturlag. NorBOL skal være med og ta prøver til DNA strekkoding, og vi ser fram til en flott helg sammen med sopp fra nord og soppentusiaster fra hele landet.

    Marie Føreid Merkel

  • Symposium Biodiversity and Humanity

    The NTNU University Museum and the Norwegian Biodiversity Information Centre has the pleasure of inviting you to the symposium Biodiversity and Humanity in Trondheim, a side-event of the Starmus-festival. Six international capacities, including Nancy Knowlton and Paul Hebert from the festival main program will reflect on biodiversity and how we as humans have influenced life and are being influenced by life on earth. Other speakers are Tom Gilbert, Maria Capa, Sujeevan Ratnasingham and Hans Stenøien. Please see Biodiversity and humanity program 2017 for details.

    The symposium is free of charge and is held 22 June at 09:00 i Akrinn, Sverresgate 12. We invite all participants for lunch after the talks, so please register here: https://ntnu.wufoo.eu/forms/registration-for-biodiversity-and-humanity/.

    At the time of the symposium, the NTNU University Museum hosts the world famous exhibition Body Worlds Vital. Tickets for the exhibition are sold separately.

    We hope to see many of you at the symposium!

    Best wishes,

    Torbjørn

  • Symposium Biodiversity and Humanity

    NTNU Vitenskapsmuseet og Artsdatabanken har den glede å invitere til symposiet Biodiversity and Humanity som arrangeres i forbindelse med Starmus-festivalen i Trondheim. Seks internasjonale kapasiteter, inkludert Nancy Knowlton og Paul Hebert fra festivalens hovedprogram, vil reflektere rundt biologisk mangfold og hvordan vi som mennesker påvirker og blir påvirket av naturen rundt oss. Øvrige foredragsholdere er Tom Gilbert, Maria Capa, Sujeevan Ratnasingham og Hans Stenøien. Se Biodiversity and humanity program 2017 for mer informasjon.

    Symposiet er gratis og holdes 22 juni, kl. 09:00 i Akrinn, Sverresgate 12, Trondheim. Arrangementet avsluttes med lunsj og vi ønsker derfor at alle deltakere registrerer seg her: https://ntnu.wufoo.eu/forms/registration-for-biodiversity-and-humanity/.

    Samtidig med symposiet vises utstillingen Body Worlds Vital ved Vitenskapsmuseet. Billetter til denne selges separat.

    Vi håper å se mange av dere på symposiet!

    Beste hilsen,

    Torbjørn

  • Paul Hebert to talk at the Starmus-festival

    What does Stephen Hawking, Buzz Aldrin, Paul Hebert, Oliver Stone and 10 Nobel Laureates have in common? They will all speak at the Starmus Festival: Life and the Universe in Trondheim, June 18-23, 2017!

    STARMUS – Life and the Universe

    Starmus is a grandiose festival. With it’s star-speckled list of speakers and artists, Starmus has as goal to bring an understanding and appreciation of science to the public at large. This is the fourth Starmus festival and as in previous years, astronauts, physicists, astrophysicists, biologists and musicians will be speaking about life, the universe and things that (dark) matter. The program is still under development, but it is already certain that the festival in Trondheim might become a ‘once in a lifetime experience’.

    So, what will the ‘father of DNA barcoding’ Paul Hebert speak about in this setting? Could it be the Planetary Biodiversity Mission? The microbiologist Emmanuelle Charpentier, the molecular biologist Susumu Tonegawa, the astrobiologist Nathalie A. Cabrol, the marine biologist Nancy Knowlton and the neurobiologists May-Britt and Edvard Moser are other famous biologists in the program.

    In addition, three moonwalkers will have a public conversation about the moon and beyond. That will also be interesting, guaranteed.

    moon-and-beyond

  • Paul Hebert til Starmus

    Hva har Stephen Hawking, Buzz Aldrin, Paul Hebert, Oliver Stone og 10 nobelprisvinnere til felles? De kommer alle til Starmus-festivalen: Life and the Universe i Trondheim 18-23 Juni, 2017!

    STARMUS – Life and the Universe

    Starmus er en storslått festival, som med sin stjernespekkede liste av foredragsholdere og artister har som mål å øke forståelsen av og gleden ved vitenskap for folk flest. Det er i år fjerde gangen festivalen arrangeres og som tidligere står både astronauter, fysikere, astrofysikere, biologer og artister på talelisten. Programmet utvides stadig, men det er allerede klart at festivalen i Trondheim fort blir en ‘once in a lifetime experience’.

    Så, hva kommer ‘strekkodingens far’ Paul Hebert til å snakke om i en slik setting? Kan det bli Planetary Biodiversity Mission? Mikrobiologen Emmanuelle Charpentier, molekylærbiologen Susumu Tonegawa, astrobiologen Nathalie A. Cabrol, marinbiologen Nancy Knowlton og neurobiologene May-Britt og Edvard Moser er andre berømte biologer på programmet.

    I tillegg skal tre månespradere konversere om månen og det bortenfor. Det blir garantert også interessant.

    moon-and-beyond

  • DNA-strekkode workshop

    NorBOL arrangerte workshop i DNA-strekkoding 6.-8. februar ved Naturhistorisk museum i Oslo. Elleve deltakere fra Norge, Sverige, Island og Danmark lærte seg prosedyrer for innsending av materiale til strekkoding gjennom NorBOL, og bidro med arter av veps, ferskvannsinsekter, edderkopper, fåbørstemark, fisk, sopp og lav til BOLD databasen.

    Et svært vellykket arrangement der mange prøver allerede er på vei til vår samarbeidspartner i Canada for sekvensering.

    Gunnhild Marthinsen, NHM

    Mari-Darrud_workshopMari Darrud, Veterinærinstituttet klargjør prøver for DNA-strekkoding. Foto Gunnhild Marthinsen CC-BY.

  • Hva skal Artsprosjektet inneholde?

    Det var en fornøyelse å delta på Artsdatabankens lansering av ”Kunnskapsstatus for artsmangfoldet i Norge 2015” på Tøyen hovedgård forrige uke. En grundig rapport basert på artskunnskapen til 60 spesialister ble presentert på en profesjonell og informativ måte. Det kom tydelig fram at dette garantert er den beste oversikten vi har hatt over artsmangfoldet i Norge noen gang. Jeg tør våge påstanden at vi aldri ville vært der vi er uten Artsprosjektet og at analysen av kjent og ukjent diversitet har blitt mer presis gjennom bruk av DNA-strekkoding og satsningen til Norwegian Barcode of Life Network (NorBOL). Toget har helt klart vært på rett spor.

    estimert-antall-uoppdagede-arter-i-norgeEt resultat fra rapporten. Estimert antall uoppdagete arter i Norge. Artsdatabanken CC-BY.

    Så hva bør Artsprosjektet inneholde i fremtiden? Det ble antydet både fra talerstolen og fra salen at Artsprosjektet bør finansiere økologiske studier av bedre kjente arter fordi dette vil gi viktig informasjon til rødlistevurderinger og et bedre grunnlag for forvaltningen av artsmangfoldet. Etter min vurdering er dette feilslått strategi. Slike studier har andre kilder til finansiering, noe også Kristin Thorsrud Teien fra Klima og miljødepartementet antydet i sitt innlegg. Oppdagelse og beskrivelse av artsmangfold gir oss grunnleggende kunnskap om alt vi vet om naturen. Det er basal kunnskap som per i dag ikke har annen kilde til ekstern finansiering enn Artsprosjektet.

    NorBOL har hatt svært stor glede og nytte av samarbeidet med Artsprosjektet. Vi har ikke bare fått muligheten til å inkludere referansedata for alle mulige artsgrupper i en åpen og tilgjengelig nasjonal forskningsinfrastruktur, men også fått bidra til å øke kompetansen på analyse og forståelse av genetisk diversitet hos våre samarbeidspartnere. DNA-strekkoding har bidratt til oppdagelse av ukjente arter, økt forståelse for kompleksiteten i ulike økosystemer og lagt til rette for nye forskningsprosjekter der molekylære verktøy benyttes til identifisering. Samarbeidet med kartleggingsprosjekt i Artsprosjektet har vært utslagsgivende for at vi i dag har nesten 12 000 arter fra Norge i det internasjonale strekkodebiblioteket.

    Jeg håper at Artsprosjektet vil følge sporet som tidligere er lagt og jobbe for oppdagelse av arter til forskning og forvaltning av norsk natur. Som rapporten slo fast er det fremdeles mye å oppdage, beskrive og kartlegge både på lands og til vanns. Artsprosjektet er et fantastisk instrument til å lappe kunnskapshullene vi har om lite kjente organismegrupper, og noe vi er stolte av internasjonalt. NorBOL ser frem til videre samarbeid om dokumentasjon av artsmangfoldet, både gjennom strekkoder og referanseobjekter i vitenskapelige samlinger.

    Torbjørn Ekrem

    Koordinator NorBOL

  • DNAqua-Net: a COST-Action for developing new genetic tools for bioassessment of aquatic ecosystems in Europe

    dnaqua_net-logo

    From the COST-Action CA152119 websiteThe protection, preservation and restoration of aquatic ecosystems and their functions is of global importance. For European states it became legally binding mainly through the EU-Water Framework Directive (WFD). In order to assess the ecological status of a given water body, aquatic biodiversity data are obtained and compared to a reference water body. The quantified mismatch thus obtained determines the extent of potential management actions. The current approach to biodiversity assessment is based on morpho-taxonomy. This approach has many drawback such as being time consuming, limited in temporal and spatial resolution, and error-prone due to variation of individual taxonomic expertise of the analysts. Novel genomic tools can overcome many of the aforesaid problems and could complement or even replace traditional bioassessment. Yet, a plethora of approaches are independently developed in different institutions, thereby hampering any concerted routine application. The goal of this Action is to nucleate a group of researchers across disciplines with the task to identify gold-standard genomic tools and novel eco-genomic indices for routine application for biodiversity assessments of European water bodies. Furthermore, DNAqua-Net will provide a platform for training of the next generation of European researchers preparing them for the new technologies. Jointly with water managers, politicians and other stakeholders, the group will develop a conceptual framework for the standard application of eco-genomic tools as part of legally binding assessments.

    The inaugural meeting of DNAqua-Net was held in the COST-building in Brussels on October 20, 2016. The COST-Action was formally accepted and chair and working group leaders were elected. So far 31 countries are associated with the action, med representatives in the Management Committee nominated by national COST-coordinators. The delegates from Norway are Trude Vrålstad (Norwegian Veterinary Institute) and Torbjørn Ekrem (NTNU University Museum). The first conference of DNAqua-Net will be held in Essen, Germany, March 6-8, 2017, with post conference meetings in the five working groups (leads in parentheses):

    • DNA Barcode References (Torbjørn Ekrem, Norge + Fédor Ciampor, Slovakia)
    • Biotic Indices & Metrics (Jan Pawlowski, Sveits + Maria Kahlert, Sverige)
    • Lab & Field Protocols (Kat Bruce, UK + Emre Keskin, Tyrkia)
    • Data Analysis & Storage (Kessy Abarenko, Estland + Diego Fontaneto, Italia)
    • Implementation Strategies & Legal Issues (Patricia Mergen, Belgia + Daniel Hering, Tyskland)

    participants-dnaqua-net-meeting-brusselsParticipants at the inaugural meeting in the COST-Action DNAqua-Net.

Translate »